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{{Infobox | bodystyle = width: 300px; float: right; clear: right; margin: 0 0 1em 1em; border: 1px solid #a2a9b1; background: #f9f9f9; | abovestyle = background: #e0e0e0; font-size: 110%; font-weight: bold; text-align: center; | headerstyle = background: #eeeeee; font-weight: bold; | above = 国家生物技术信息中心<br><small>National Center for Biotechnology Information</small> | image = | label1 = 英文缩写 | data1 = '''NCBI''' | label2 = 上级机构 | data2 = [[NIH]] 下属的 NLM | label3 = 成立时间 | data3 = 1988年 (克劳德·佩珀法案) | label4 = 核心数据库 | data4 = [[GenBank]]、[[PubMed]]、<br>ClinVar、dbSNP | label5 = 著名工具 | data5 = [[BLAST]] (序列比对)、<br>Entrez (检索系统) | label6 = 对AI价值 | data6 = 全球最大的生物信息<br>结构化数据中心 }} '''国家生物技术信息中心'''({{lang-en|National Center for Biotechnology Information}},简称'''NCBI'''),是美国[[NIH]]下属的一个分支机构,位于马里兰州的贝塞斯达。 NCBI 的核心任务是开发自动化的信息处理系统,以存储、分析和解释分子生物学、生物化学和遗传学数据。对于生物医药行业,NCBI 实际上扮演了全球“生物数据央行”的角色。您的技术团队每天调用的 API 接口(E-utilities),绝大部分直接指向 NCBI 的服务器。<ref name="NCBI_Mission" /> == 核心数据库 (AI 的“粮食”) == NCBI 维护着数十个数据库,其中对您的“基因医生”和“智慧医生”项目至关重要的包括: === 1. GenBank (基因银行) === * '''内容''':包含所有已公开的 DNA 序列。 * '''价值''':这是您的“基因医生”进行测序比对的基础参照系。任何新发现的基因突变,都必须与 GenBank 中的参考序列(RefSeq)进行比对才能确认。 === 2. ClinVar (临床变异库) === * '''内容''':记录基因变异(Variation)与人类健康(Phenotype)之间的关系。 * '''核心价值''':这是'''AI 诊断'''的黄金标准。 ** 当您的 AI 发现患者有一个 `BRCA1` 基因突变时,它怎么知道这个突变是“致病的”(Pathogenic)还是“良性的”(Benign)? ** 答案就在 ClinVar。它汇集了全球专家的判读结果。如果 ClinVar 说它是致病的,您的 AI 才能在报告里提示风险。 === 3. dbSNP (单核苷酸多态性库) === * '''内容''':收录人类和其他物种的微小基因变异(SNP)。 * '''价值''':用于药物基因组学分析(例如:为什么某种药对这个人无效?可能是因为某个 SNP 导致的代谢酶差异)。 === 4. PubMed & PMC === * 虽然由 NLM 管辖,但实际的数据托管和检索引擎是由 NCBI 的技术团队维护的。 == 核心工具与技术 == === 1. BLAST (局部比对搜索工具) === * '''Basic Local Alignment Search Tool'''。 * 这是生物信息学领域的“Google”。输入一段未知的 DNA 序列,BLAST 能在几秒钟内从数十亿条序列中找出它属于哪个物种、哪个基因。 * ''AI应用'':您的系统在处理原始测序数据(FASTQ文件)时,底层算法往往依赖 BLAST 或其变体。 === 2. Entrez Programming Utilities (E-utilities) === * 这是 NCBI 提供的标准 API 接口。 * '''自动化''':您的 AI 后台可以通过 E-utilities 自动抓取最新的文献、基因数据和变异信息,实现知识库的每日自动更新(Daily Build)。 == 组织架构关系 == 很多非专业人士容易混淆,但您需要清晰区分: * '''[[NIH]]''' = '''出资方'''(政府部门,大老板)。 * '''NLM''' = '''管理方'''(国家医学图书馆,NCBI 的顶头上司)。 * '''NCBI''' = '''运营方'''(IT 部门,负责写代码、修服务器、维护数据库)。 == 参见 == * [[NIH]] * [[PubMed]] * [[GenBank]] * [[生物信息学]] * [[人类基因组计划]] == 参考资料 == <references> <ref name="NCBI_Mission">National Center for Biotechnology Information. (2023). Our Mission. [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/about/mission.shtml]</ref> </references> [[Category:生物信息学]] [[Category:在线数据库]] [[Category:美国政府机构]]
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