CRISPR/Cas9
CRISPR/Cas9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats / CRISPR-associated protein 9)是生物学历史上革命性的基因编辑技术,被誉为“上帝的分子剪刀”。它源自细菌和古菌的适应性免疫系统,用于抵御病毒(噬菌体)的入侵。科学家将其改造为一种可编程的工具,能够以极高的精度、低廉的成本在活细胞的 DNA 上进行搜索、切割和修饰。这项技术彻底改变了生命科学研究,并在治疗遗传性疾病(如镰状细胞贫血)、癌症免疫疗法以及农业育种领域展现出巨大的应用潜力。2020 年,Emmanuelle Charpentier 和 Jennifer Doudna 因开发该技术荣获诺贝尔化学奖。
工作原理:定位、锁定与剪切
CRISPR/Cas9 系统是一个二元系统,主要由负责“导航”的 RNA 和负责“切割”的蛋白质组成。其工作流程可以分为三个阶段:
| 步骤 | 详细机制 (Mechanism) | 关键术语 |
|---|---|---|
| 1. 识别与结合 (Recognition) |
人工设计的 sgRNA (Single Guide RNA) 携带一段约 20 个碱基的序列,在基因组中寻找互补的 DNA 片段。 | 互补配对 |
| 2. 锁定与核查 (PAM Binding) |
Cas9 蛋白必须首先识别目标 DNA 旁边的一个短序列——PAM (通常为 NGG)。没有 PAM,Cas9 即使匹配了 RNA 也不会切割(这是为了防止细菌切割自身的 CRISPR 记录序列)。 | PAM (原间隔序列临近基序) |
| 3. 双链断裂 (Cleavage) |
一旦定位并验证 PAM,Cas9 的两个核酸酶结构域 (RuvC 和 HNH) 激活,分别切断 DNA 的两条链,造成 双链断裂 (DSB)。 | DSB (Double Strand Break) |
| 4. 细胞修复 (Repair) |
细胞检测到断裂后会启动修复:
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NHEJ vs HDR |
技术对比:为什么 CRISPR 是革命?
从“定制蛋白”到“定制 RNA”
在 CRISPR 之前,基因编辑工具如 ZFNs (锌指核酸酶) 和 TALENs 需要为每一个靶点专门设计和构建复杂的蛋白质,耗时数月且昂贵。
CRISPR 的优势: 只需要改变一段简单的 sgRNA 序列即可改变靶点。这使得基因编辑的门槛大幅降低,从“几个月的工程”变成了“几天的实验”,且易于实现多重编辑(一次编辑多个基因)。
挑战:脱靶效应 (Off-target Effects)
CRISPR 的主要风险在于它可能在基因组的其他非预期位置进行切割。如果这种“误伤”发生在抑癌基因上,可能导致癌症。目前的改进版本(如 Cas9-HF, Prime Editing)正致力于将这种风险降至最低。
💊 临床里程碑:Casgevy
2023 年底,全球首款 CRISPR 基因编辑疗法 Casgevy 获得 FDA 批准,用于治疗镰状细胞贫血和输血依赖性β-地中海贫血。
原理: 提取患者的造血干细胞,利用 CRISPR/Cas9 破坏 BCL11A 基因的增强子,重新激活胎儿血红蛋白 (HbF) 的表达,从而补偿受损的成人血红蛋白。
学术参考文献与权威点评
[1] Jinek M, Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E. (2012). A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity. Science. 2012;337(6096):816-821.
[奠基之作]:Doudna 和 Charpentier 首次证明 Cas9 可以被重新编程以切割任意 DNA 序列,奠定了其作为基因编辑工具的基础。
[2] Cong L, Ran FA, Cox D, Lin S, Barretto R, Habib N, Hsu PD, Wu X, Jiang W, Marraffini LA, Zhang F. (2013). Multiplex genome engineering using CRISPR/Cas systems. Science. 2013;339(6121):819-823.
[哺乳动物应用]:张锋(Feng Zhang)团队首次证明 CRISPR/Cas9 可以在哺乳动物(人类)细胞中有效工作。
[3] Doudna JA, Charpentier E. (2014). The new frontier of genome engineering with CRISPR-Cas9. Science. 2014;346(6213):1258096.
[权威综述]:两位诺奖得主系统总结了 CRISPR 的生物学机制及其在生物技术和医学中的广阔前景。