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'''甲基化'''(Methylation)指向[[底物]]引入甲基的过程,一般是以甲基取代氢原子。 在[[生物系统]]内,甲基化是经[[酶催化]]的,这种甲基化涉及重金属修饰、[[基因表达]]的调控、[[蛋白质]]功能的调节以及[[核糖核酸]]([[RNA]])加工。重金属修饰可以在生物系统外发生。组织样本的[[化学]]甲基化也是组织[[染色]]的方法之一。 ==生物甲基化== ===[[表观遗传学]]=== 表观遗传学的甲基化包括[[DNA甲基化]]或蛋白质甲基化。<br> 1)DNA甲基化。[[脊椎动物]]的DNA甲基化一般发生在CpG[[位点]]([[胞嘧啶]]-[[磷酸]]-[[鸟嘌呤]]位点,即[[DNA序列]]中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点)。经[[DNA]]甲基转移酶催化胞嘧啶转化为[[5-甲基胞嘧啶]]。人类[[基因]]中约80%-90%的CpG位点已被甲基化,但是在某些特定区域,如富含胞嘧啶和鸟嘌呤的CpG岛则未被甲基化。这与包含所有广泛表达基因在内的56%的哺乳动物基因中的[[启动子]]有关。1%-2%的人类[[基因组]]是CpG群,并且CpG甲基化与[[转录]]活性成反比。 2)蛋白质甲基化。蛋白质甲基化一般指[[精氨酸]]或[[赖氨酸]]在蛋白质序列中的甲基化。<ref name="isbn0-9747077-3-2. ">{{cite book |first1=Christopher| last1= Walsh |title=Posttranslational modification of proteins: expanding nature's inventory |publisher=Roberts and Co. Publishers |location= |year=2006 |pages= |chapter=Chapter 5 – Protein Methylation |isbn=0-9747077-3-2. |oclc= |chapterurl=http://www.roberts-publishers.com/walsh/chapter5.pdf |doi=}}</ref>精氨酸可以被甲基化一次(称为一[[甲基精氨酸]])或两次(精氨酸[[甲基转移酶]](PRMTs)将两个甲基同时转移到精氨酸[[多肽]]末端的同一个氮原子上成为非对称性甲基精氨酸,或者在每个氮端各加一个甲基成为对称性[[二甲基精氨酸]])赖氨酸经赖氨酸[[转移酶]]的[[催化]]可以甲基化一次、两次或三次。在[[组蛋白]]中,蛋白质甲基化是被研究最多的一类。在组蛋白转移酶的催化下,[[S-腺苷甲硫氨酸]]的甲基转移到组蛋白。某些组蛋白[[残基]]通过甲基化可以抑制或激活基因表达,从而形成为表观[[遗传]]。<ref name="Grewal2004">{{cite doi|10.1016/j.ceb.2004.04.002}}</ref><ref name="Nakayama2001">{{cite doi|10.1126/science.1060118}}</ref>蛋白质甲基化是[[翻译后修饰]]的一种形式。 ===[[胚胎发育]]=== 在[[生殖细胞]]发育的过程中基因组进行去甲基化,而[[体细胞]]中的[[染色体]]则保留了[[亲本]]甲基化模式。此后,个体的性基因组通过生殖细胞的重新甲基化进行[[遗传信息]]的修改和添加。<ref name="Carroll2008">{{cite book | first1 = Sean B | last1= Carroll | first2= Susan R | last2= Wessler| first3= Anthony J. F | last3= Griffiths | first4= Richard C| last4= Lewontin |title=Introduction to genetic analysis |publisher=W.H. Freeman and CO |location=New York |year=2008 |page=403 |isbn=0-7167-6887-9 |edition=9th}}</ref>[[卵母细胞]][[受精]]后形成[[合子]],它的联合基因组进行去甲基化和重新甲基化(除了印迹基因)。通过[[囊胚]]阶段,[[胚胎干细胞]]的甲基化已完成。这种去甲基化/重新甲基化过程被称为“重新编程”。<ref name="Mann2002">{{cite doi|10.1186/gb-2002-3-2-reviews1003}}</ref>甲基化在没有DNA甲基化转移酶的基因剔除[[突变]]中尤为重要,所有生成的[[胚胎]]会在囊胚时期死亡。<ref name="Woroniecki2010">{{cite doi|10.1007/s00467-010-1714-8}}</ref> ===出生后发育=== 越来越多的证据揭示,甲基化在环境因素和[[遗传表达]][[交互作用]]间发挥重要作用。在小鼠刚出生的前6天里,不同的护理方式会诱导一些启动子区域不同的甲基化模式,从而影响基因的表达。<ref name="Weaver2007">{{cite doi|10.4161/epi.2.1.3881}}</ref>此外,如[[白细胞介素]]的信号[[传导]]等更动态的过程,也是通过甲基化来调控的。<ref name="Bird2003">{{cite doi|10.1038/ni0303-208}}</ref>人类研究证明重复高强度地激活人体的压力系统,尤其是在儿童早期,可以改变甲基化过程,并导致个体DNA的化学变化。这种化学改变能[[抑制基因]]并阻碍[[大脑]]对[[应激反应]]的调节。研究人员和临床医生得出这种[[神经]]失调和慢性健康问题之间有关联,如[[抑郁症]],[[肥胖症]],[[高血压]]及[[冠心病]]。<ref name="Caldji2011">{{cite doi|10.1016/j.febslet.2011.03.032}}</ref><ref name="Champagne2005">{{cite doi|10.1016/j.conb.2005.10.001}}</ref><ref name="Champagne2006">{{cite doi|10.1210/en.2005-1119}}</ref><ref name="Felitti1998">{{cite doi|10.1016/S0749-3797(98)00017-8}}</ref><ref name="McEwen2010">{{cite doi|10.1111/j.1749-6632.2009.05331.x}}</ref> ===[[癌症]]=== 最近甲基化模式研究成为一个重要研究课题。研究发现正常组织中的基因甲基化主要集中于缺乏CpG的[[编码区]];相反,[[基因启动子]]区域,尽管启动子区域中CpG岛的密度很高,基因却是未甲基化的。[[肿瘤]]的特点是甲基化失衡,即全基因组甲基化伴随局部甲基化和基因甲基化转移酶的表达增高。某些基因的甲基化状态可以被看做肿瘤生物标志物而加以利用。例如:[[谷胱甘肽]]S转移酶P1的甲基化被认为是一个很有前途的[[前列腺癌]]的诊断指标。<ref name="Nakayama2004">{{cite doi|10.1002/jcb.10740}}</ref> 在癌症中,遗传的动态性和表观[[遗传基因]]沉默有很大的不同。体细胞基因的突变阻碍了功能性[[蛋白]]从突变的[[等位基因]]中的表达。如果该[[细胞]]具备生存[[选择优势]],其[[扩增]][[克隆]]会导致所有的细胞都无法产生蛋白质从而导致肿瘤的产生。相比之下,表观遗传介导的基因沉默是逐渐发生的,从转录的微量减少开始,随[[异质]]基因的扩增和甲基化促进了CpG岛的保护功能受到损伤,这种损伤的结果是导致在不同细胞不同克隆的同一基因中多样化的单个CpG位点的逐步增加。<ref name="Jones2002">{{cite doi|10.1038/nrg816}}</ref> ===[[细菌]][[宿主]]防御=== 此外,[[腺苷]]或胞嘧啶的甲基化是许多细菌限制修饰系统的一部分。细菌的基因在整个基因组中定期进行甲基化。甲基化酶能识别某特定序列并进行甲基化。没有以这种方式进行甲基化的基因则被引入到细胞中被序列特异性[[限制内切酶]]所降解。而细菌基因组DNA则无法被这些[[限制性内切酶]]所识别。DNA甲基化作为一种原始[[免疫系统]],使细菌保护自己免受[[噬菌体]]的[[感染]]。在DNA[[多态性]]检测中,这些限制性内切酶是限制片段长度多态性(RFLP)测试的基础。 ==化学甲基化== [[Image:Iodomethane rxn1.png|350px|[[碘甲烷]]甲基化羧[[酸盐]]和[[苯酚]]]] 在有机化学中甲基化指的是转移甲基(CH3)基团的烷基化过程。<ref name="isbn0-471-58589-0">{{cite book |first1=Jerry | last1=March|first2=Michael W| last2=Smith |title=March's advanced organic chemistry: reactions, mechanisms, and structure |publisher=Wiley |location=New York |year=2001 |pages= |isbn=0-471-58589-0 |oclc= |doi=}}</ref>此过程经常采用亲电子的甲基源,如碘甲烷、[[硫酸二甲酯]]、碳酸二甲酯,或较少使用但更强力(更危险)的甲基化[[试剂]],如产生SN2亲核取代反应的三氟[[甲磺酸]]甲酯或氟[[磺酸]]甲酯。例如,羧酸盐可被氧甲基化得到甲基酯,醇盐盐RO−也可通过甲基化释放[[乙醚]],ROCH3或酮的[[烯醇]]化物通过甲基碳而产生一个新的酮。 [[Image:MeLi on acetone.png|250px|[[甲基锂]]甲基化[[丙酮]]]] 另一方面,可能使用亲核的甲基[[化合物]]进行甲基化,例如甲基锂 (CH3Li)或格氏试剂 (CH3MgX)。 例如,CH3Li可以与丙酮中的羰基(C=O)甲基化,并产生[[叔丁醇]]的锂盐: ===珀迪-欧文甲基化法=== [[Image:Purdie methylation.png|500px|珀迪-欧文甲基化法]] 珀迪-欧文甲基化法是采用[[糖类]]与过量碘甲烷在氧化银存在的条件下发生彻底甲基化反应的一种特定甲基化方法。<ref name="Purdie1903">{{cite doi|10.1039/CT9038301021}}</ref> == 参考 == {{reflist}} == 外部连结 == *[http://www.methdb.de/ DNA Methylation Database] *[http://www.epigeneticsnews.com/ Epigenetics News] *[http://www.epigeneticstation.com/ Epigenetic Resource and Protocol Centre] {{蛋白质一级结构}} [[Category:表观遗传学]] [[Category:有机反应]] [[Category:翻译后修饰]] [[Category:甲基化试剂]] ==参考来源== *[http://zh.wikipedia.org/wiki/%E7%94%B2%E5%9F%BA%E5%8C%96 维基百科-甲基化]
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