粪口传染常见于发展中国家卫生系统尚未健全、教育宣导不周的情况下，未处理之废水或受病原沾染物，直接排放于环境中，可能污损饮水、食物或碰触口、鼻黏膜之器具，以及如厕后清洁不完全，借由饮食过程可导致食入者感染，主要病原可为病毒、细菌、寄生虫，如霍乱、甲型肝炎、小儿麻痹、轮状病毒、弓型虫感染症（T. gondii），于发达国家也可能发生。有时，某些生物因体表组织构造不足以保护个体，可能因接触患者之排泄物而受到感染，正常情况下在人类族群中不会发生这种特例。