SMARCB1缺失

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SMARCB1 缺失(亦称 INI1 缺失)是多种高度恶性肿瘤的驱动性分子病变。SMARCB1 基因位于 22 号染色体,编码 BAF (mSWI/SNF) 染色质重塑复合物 的核心亚基,发挥关键的抑癌作用。在生理状态下,SMARCB1 介导 BAF 复合物与 Polycomb (PRC2) 复合物的拮抗,维持抑癌基因(如 p16INK4A)的开放状态。当 SMARCB1 发生纯合缺失或灭活突变时,这种拮抗平衡被打破,导致全基因组范围内 H3K27me3 压制信号异常堆积。临床上,这一缺失是诊断 上皮样肉瘤、恶性横纹肌样瘤及非典型畸胎瘤样/横纹肌样瘤(ATRT)的“金标准”,并为 他泽司他 等表观遗传药物提供了合成致死的治疗窗口。

SMARCB1 · 缺失档案
SMARCB1 (INI1) Deficiency Profile
核心抑癌亚基缺失 / 表观驱动
基因符号 SMARCB1
常用别名 INI1, SNF5, BAF47
染色体定位 22q11.23
Entrez ID 6598
HGNC ID 11103
UniProt Q12824
分子量 约 44 kDa
检测金标准 IHC 表达缺失

分子机制:拮抗失效导致的表观崩溃

SMARCB1 并非 ATP 酶,而是作为 BAF 复合物的“结构支架”和“拮抗介导子”存在。

  • 失控的沉默标志: 在健康细胞中,含有 SMARCB1 的 BAF 复合物会物理性地驱逐 PRC2 复合体,防止其在抑癌基因区域添加抑制性的 H3K27me3 标记。当 SMARCB1 缺失时,PRC2 的活性在这些位点变得无可制约。
  • 染色质构象坍塌: SMARCB1 的缺失导致 BAF 复合物整体稳定性下降,无法有效维持增强子和启动子的开放状态。这直接导致了细胞分化程序的停滞和干性基因的异常上调。
  • 滑膜肉瘤中的“功能性缺失”: 虽然滑膜肉瘤患者基因组中 SMARCB1 序列完整,但 SS18-SSX 融合蛋白会竞争性地整合进 BAF 并物理排挤 SMARCB1。这种“驱逐效应”模拟了基因缺失的表型。

临床景观:SMARCB1 缺失相关的肿瘤谱系

肿瘤类型 病理诊断特征 临床意义 (2025 共识)
上皮样肉瘤 (ES) >90% 病例表现为核 INI1 IHC 表达彻底丧失。 FDA 批准: 他泽司他在该适应症中已获批,针对表观遗传缺陷进行精准打击。
恶性横纹肌样瘤 (MRT) SMARCB1 基因纯合失活,IHC 表达阴性。 极具侵袭性的儿童肿瘤,对常规化疗极度耐药。
肾髓质癌 (RMC) 几乎 100% 存在 SMARCB1 缺失。 与镰状细胞特性高度关联,预后极差,亟需表观遗传联合免疫治疗。
滑膜肉瘤 IHC 减弱或不均一表达(非彻底消失)。 由于亚基被驱逐,呈现功能性缺失状态。

治疗策略:基于合成致死的表观重塑

  • EZH2 抑制剂(他泽司他): 利用 PRC2 处于绝对强势的弱点,抑制其核心催化酶 EZH2,从而强制基因组恢复平衡。这是目前 SMARCB1 缺失肿瘤最成功的靶向策略。
  • CDK4/6 抑制剂: SMARCB1 缺失通常导致 p16 沉默,进而引起细胞周期失控。临床前研究显示 CDK4/6i 在 MRT 等肿瘤中具有协同增效潜力。
  • 表观-免疫启动 (Epigenetic-Immune Prime): 恢复 SMARCB1 功能或抑制 EZH2 可诱导肿瘤表面 HLA 分子及 NY-ESO-1 等抗原上调,显著提升 TCR-T 细胞疗法 的识别效率。

关键关联概念

  • INI1 IHC: 软组织肉瘤病理分型的核心免疫组化指标。
  • BAF 复合物: SMARCB1 所在的分子重塑机器。
  • 合成致死: 针对抑癌基因缺失的治疗逻辑。
  • PRC2 拮抗: SMARCB1 最主要的生物学对手。
       学术参考文献与权威点评

[1] Versteege I, et al. (1998). Trunkating mutations of the SMARCB1 gene in malignant rhabdoid tumors. Nature.
[学术点评]:里程碑式论文,首次确立了 SMARCB1 作为经典抑癌基因在肉瘤发生中的核心驱动作用。

[2] Gounder M, et al. (2020). Tazemetostat in patients with advanced epithelioid sarcoma with loss of INI1/SMARCB1: a phase 2 study. The Lancet Oncology.
[临床价值]:该研究开启了软组织肉瘤针对 BAF 复合物缺陷进行表观遗传干预的新时代。

[3] Kadoch C, Crabtree GR. (2013). Reversible disruption of mSWI/SNF (BAF) complexes by the SS18-SSX oncogenic fusion. Cell.
[学术点评]:揭示了滑膜肉瘤中 SMARCB1 被驱逐的功能性缺失机制,将两种不同肉瘤的病理逻辑进行了深度统一。

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