新生儿在通过产道时可以从母体传染上淋球菌性结膜炎。美国多数州立法要求常规给新生儿滴眼药水，常用药物为硝酸银，抗生素眼膏（如红霉素），以杀灭可引起淋球菌性结膜炎的细菌。成年人在性交中如果带菌的精液进入眼睛，也会感染上淋球菌性结膜炎，但成年人一般仅仅单眼受累。
在受到感染12～48小时内，患眼开始充血、疼痛，如果不治疗，则可以形成角膜溃疡或角膜脓肿，甚至导致眼球穿孔和失明。抗生素片剂、针剂、或滴眼剂均可用以治疗淋球菌性结膜炎。